Obsidian genkender følgende filformater på nuværende tidspunkt: 1. Markdown filer: `md`; 2. Billed filer: `png`, `jpg`, `jpeg`, `gif`, `bmp`, `svg`; 3. Lyd filer: `mp3`, `webm`, `wav`, `m4a`, `ogg`, `3gp`, `flac`; 4. Video filer: `mp4`, `webm`, `ogv`, `mov`, `mkv`; 5. PDF filer: `pdf`. Alle disse filtyper kan [[Indlejre filer|indlejres]] i en note. Bemærk at supporten for lyd og videoformater afhænger af de tilgængelige codecs på den enkelte enhed.